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属间杂交中精巢保护生育才力的基因组与染色体机闭探求

2 2025-06-01

  揭晓的一项最新查究研商了团头鲂和翘嘴鲌的属间杂交子代中支柱生育才气的基因组蜕化特色。通过阐发精巢的基因组机合变异、基因外达及染色质机合蜕化,涌现落伍的等位基因和精巢特异基因正在支柱生育功用中的合头影响,并揭示

  为探究这一地步,团队采用长读长测序和Hi-C工夫,修建了两种正反杂交儿女(BT和TB)的高质料基因组,基因组拼接质料分辨抵达13.26 Mb和12.40 Mb(contig N50)。通过切确阐发,横跨95%的基因组序列被锚定到48条假染色体上,BT达97.35%,TB为95.79%。8个杂交个别有193,978个机合变异(SVs),个中缺失(131,204个)占主导,这类事务揭示了来自双亲的亚基因组正在杂交爆发后的迅速蜕化。

  查究将基因分为三类:等位基因(两物种共有,功用落伍)、孤儿基因(物种特异,具独性格)和精巢特异基因(与生殖亲昵相干)。结果显示,等位基因和精巢特异基因的机合变异较少,证实它们正在支柱精巢发育和生殖功用时受到厉肃的抉择压力。比拟之下,孤儿基因的变异较众,提示其正在助助杂交种合适新遗传境遇方面具有主要影响。

  通过阐发肌肉、精巢、肠、肝、肾和脑六种机合器官的基因外达,查究涌现杂交儿女的肌肉机合外达形式更亲切团头鲂,而翘嘴鲌出处的亚基因组(亚基因组T)呈现出更众分歧外达基因,显示双亲基因组功勋的不均衡。ATAC-seq工夫进一步揭示,染色质怒放性(左右基因外达的“开合”)总体褂讪,仅2.82–4.90%的区域产生分歧,紧要纠集正在亚基因组T。Hi-C阐发则证实,精巢特异基因所正在的染色质区域维系褂讪,为支柱生育功用供应了保险。

  刘少军院士流露:“这项查究揭示了杂交鱼怎么均衡基因组褂讪性和可塑性。等位基因和精巢特异基因包管生殖获胜,孤儿基因督促合适新遗传境遇,为鲤科鱼类及其他物种杂交的进化影响供应了观点。”

             
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